लीन कार्यान्वयन अक्सर उन कारणों से विफल हो जाता है जिनका लीन टूल्स से कोई सीधा संबंध नहीं होता। संगठन अक्सर प्रक्रिया क्या है, यह कहाँ से शुरू और समाप्त होती है, इस पर कौन निर्भर करता है, और वास्तव में कौन से परिणाम मायने रखते हैं, इस बारे में एक साझा समझ स्थापित किए बिना ही 5S, Kaizen, Value Stream Mapping, Standard Work, Kanban, या OEE को लागू करने में जल्दबाजी करते हैं।