कोई भी खाद्य संगठन आईएसओ 22000 या एफएसएससी 22000 में से किसी को भी लागू करने का विकल्प चुन सकता है, यह ध्यान में रखते हुए कि प्रत्येक कंपनी अद्वितीय है। खाद्य सुरक्षा प्रबंधन प्रणाली की प्रभावशीलता इस बात पर निर्भर करती है कि कंपनी मानक की आवश्यकताओं को धार्मिक रूप से कैसे लागू करती है।